また、感染した菌が体の奥へと進んでいき、感染した時期によっては検査した場所にクラミジアがいない場合もよくあります。「検査をしたのに陰性だった。」という場合もありうるのです。
感染してしばらく時間が開いてしまった場合や、感染時期を良く覚えていない場合などには抗原検査が陰性にでる時がありますので、血中抗体検査法で検査したほうがより正確な結果がでるようです。
血中抗体検査は、体内に病原菌が入って、体が病原体を戦うために免疫グロブリンを作ります。免疫グロブリンにはいろいろな種類があって、その組み合わせによって感染の状態とか、感染してからの時間を推定します。
（血中抗体検査の見方）
体内に病原菌が侵入した際にその病原菌と戦うために免疫グロブリンが生成されます。免疫グロブリンには５種類がありますがそのうち２つの組み合わせによって感染状態、感染してからの経過時間が推定できます。
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【抗体IgA】 【抗体IgG】 【判定の仕方】
活動性をみる 感染の既往歴をみる
各種粘膜,唾液,涙に有
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− − ⇒ 感染していない
＋ − ⇒粘膜に感染している可能性有
（初期の感染）
− ＋ ⇒ 感染歴がある
（抗原検査が陽性なら、現在感染している）
＋ ＋ ⇒ 過去感染して、現在も感染状態
（感染が慢性的な状態）
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【判定】
index
0.90未満 ； −
0.90〜1.10 ； （＋−） ⇒１０日以降に採取の血液での再検査をお勧めします。
1.11以上 ； ＋
【抗体IgM】 感染すると最初に増えるがすぐ消える。
IgA抗体値が高いとき；クラミジア感染が現在活動的である（⇒他の人に感染する可能性が高い）
IgG抗体値が高いとき；クラミジアに感染した（既往歴）ことがある
以上２点を推測するのに利用されます。
抗体検査は抗原検査が困難な場合の補助診断としてその利用価値はありますが、確定診断にはなりません。
クラミジアに感染すると子宮頸管⇒子宮内膜⇒卵管上皮さらに腹水中へと上行性に進んで行きます。このように慢性的に感染した事例では、子宮頸管内にクラミジア菌の存在しないことが少なくありません。
特に問題になるのは継続感染です。薬をきちんと服用しないなどの治療が不充分な場合もあてはまりますし、このような事例では抗体価が順調に下降していきません。
このように「抗体価の下降不良」では継続感染に注意が必要です。
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